Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms