Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SMG1Q96Q15 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SMG1Q96Q15 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
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