Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAPPC9Q96Q05 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms