Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAB3CQ96E17 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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