Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GRIK4Q16099 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms