Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HERC3Q15034 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC3Q15034 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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