Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCARB2Q14108 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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SCARB2Q14108 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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SCARB2Q14108 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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SCARB2Q14108 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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SCARB2Q14108 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SCARB2Q14108 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCARB2Q14108 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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SCARB2Q14108 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCARB2Q14108 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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