Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CDH18Q13634 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDH18Q13634 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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