Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEUROD1Q13562 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NEUROD1Q13562 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NEUROD1Q13562 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NEUROD1Q13562 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NEUROD1Q13562 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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