Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
FOXE3Q13461 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXE3Q13461 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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