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| PTK7 | Q13308 | SNORD24-201 | ENST00000383884 | 75 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA11.4-201 | ENST00000408823 | 129 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC020743.3-201 | ENST00000440351 | 360 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL109933.2-201 | ENST00000452651 | 260 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01203-202 | ENST00000456091 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC007751.1-201 | ENST00000529260 | 376 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| PTK7 | Q13308 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC108866.1-201 | ENST00000503073 | 2339 nt | TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLCO1B3-201 | ENST00000261196 | 2840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | CPD-202 | ENST00000543464 | 4007 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-888P-201 | ENST00000363010 | 101 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | U8.9-201 | ENST00000365667 | 134 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1292P-201 | ENST00000383856 | 107 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR891A-201 | ENST00000401237 | 79 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | CFLAR-AS1-202 | ENST00000474886 | 223 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP367-201 | ENST00000516557 | 118 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR4506-201 | ENST00000584693 | 77 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | PRKACB-218 | ENST00000610703 | 4240 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | FAM46D-201 | ENST00000308293 | 3011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | GRAMD1C-202 | ENST00000440446 | 3475 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SENP7-201 | ENST00000314261 | 4736 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | CEP57L1-216 | ENST00000521522 | 2259 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD61-201 | ENST00000384252 | 73 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.525-201 | ENST00000384570 | 113 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR522-201 | ENST00000385071 | 87 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SKP123-201 | ENST00000410732 | 291 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | AF228730.3-201 | ENST00000436691 | 102 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNRPGP13-201 | ENST00000442212 | 177 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL135938.1-201 | ENST00000443141 | 297 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC122707.1-201 | ENST00000502882 | 219 nt | TSL 2 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-693P-201 | ENST00000516134 | 107 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1270P-201 | ENST00000517128 | 108 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC091544.4-201 | ENST00000555268 | 342 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR3162-201 | ENST00000581818 | 82 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | C5orf51-201 | ENST00000381647 | 5241 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | IL6ST-201 | ENST00000336909 | 8776 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR148B-201 | ENST00000362252 | 99 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD68-201 | ENST00000363214 | 84 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.280-201 | ENST00000364765 | 112 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1144P-201 | ENST00000384247 | 104 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | FAR2P3-204 | ENST00000434661 | 444 nt | TSL 2 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP217-201 | ENST00000515959 | 91 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.666-201 | ENST00000516187 | 112 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | CHD9-213 | ENST00000564845 | 11504 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.87 | | |
| PTK7 | Q13308 | ROS1-202 | ENST00000368508 | 7435 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | TANK-201 | ENST00000259075 | 2152 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLCO1B3-202 | ENST00000381545 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.34 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1084P-201 | ENST00000362498 | 107 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA1-201 | ENST00000384107 | 130 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL136985.1-201 | ENST00000424592 | 395 nt | TSL 3 BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRBV12-1-201 | ENST00000479785 | 344 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-56P-201 | ENST00000516986 | 93 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU2-60P-201 | ENST00000517290 | 128 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |