Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CSTF3Q12996 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CSTF3Q12996 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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