Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXF2Q12947 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXF2Q12947 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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