Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NFIAQ12857 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIAQ12857 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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