Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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RFXAPO00287 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RFXAPO00287 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RFXAPO00287 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RFXAPO00287 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFXAPO00287 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFXAPO00287 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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