Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SOBPA7XYQ1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SOBPA7XYQ1 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SOBPA7XYQ1 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SOBPA7XYQ1 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SOBPA7XYQ1 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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