Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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