Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP35Q9P2H5 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP35Q9P2H5 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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USP35Q9P2H5 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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USP35Q9P2H5 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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USP35Q9P2H5 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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