Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN2Q9H000 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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