Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD1Q9GZZ0 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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