Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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ZBED3Q96IU2 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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