Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB3CQ96E17 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAB3CQ96E17 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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