Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TPRNQ4KMQ1 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TPRNQ4KMQ1 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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