Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSMPQ1L6U9 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSMPQ1L6U9 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms