Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PKN1Q16512 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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