Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
E2F4Q16254 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
E2F4Q16254 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms