Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PCOLCEQ15113 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PCOLCEQ15113 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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