Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ODF1Q14990 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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