Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SCARF1Q14162 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SCARF1Q14162 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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