Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCINQ13939 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCINQ13939 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCINQ13939 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCINQ13939 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCINQ13939 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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