Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ALCAMQ13740 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ALCAMQ13740 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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