Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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