Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUSC3Q13454 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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