Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHAF1BQ13112 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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