Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EPHB4P54760 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
EPHB4P54760 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478 ms