Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms