Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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HOXD10P28358 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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HOXD10P28358 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
HOXD10P28358 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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