Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1Q9UJ41 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1Q9UJ41 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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