Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NLRC3Q7RTR2 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NLRC3Q7RTR2 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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