Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HIF1AQ16665 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HIF1AQ16665 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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