Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ACKR1Q16570 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ACKR1Q16570 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms