Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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