Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SNAPC1Q16533 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNAPC1Q16533 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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