Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KARSQ15046 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KARSQ15046 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KARSQ15046 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KARSQ15046 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KARSQ15046 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KARSQ15046 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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