Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ODF1Q14990 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ODF1Q14990 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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