Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCN5AQ14524 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SCN5AQ14524 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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