Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RBM39Q14498 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms