Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CTTNQ14247 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.8 ms