Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SPIDRQ14159 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms