Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
APOFQ13790 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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APOFQ13790 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
APOFQ13790 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
APOFQ13790 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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