Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SNX1Q13596 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNX1Q13596 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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